「纲目汉方 本草治伤」
这首《本草纲目》用中药代表中国人，除了功夫，中药也是我们的祖先辛辛苦苦寻找的，自然是我们独有的标签！这首歌也是告诉大家我们的祖先是有多么了不起！不同时代的两个中国人，用不同的方法与形式影响着我们的情感与尊严。传达而来的主题十分明确，那便是：民族意识，自强不息。
曲名沿用医者李时珍所撰写的医学名著《本草纲目》，在歌词的呈现部分就融入了这本医学名著的内容。歌曲本身是最使我上瘾的事物，并非它的酷，炫，而是这首作品本身的核心——增四度音程运用。这算是打破中国风常规的一种模式了。在很多人的印象中，中国风的作品大多都类似“宫商角徵羽”这样的排版，即便内容中“变徵”“变宫”“青角”“闰”这样不协和内容的音出现，也是很少数地在过度的地方，或是以加花的形式呈现给听众。毕竟“中国风”的内容会更偏向于协和音程的进行。《本草纲目》反其道而行之，选择以不协和音程为主调的方式进行呈现，这对于当时的中国风的音乐来说，无疑是一种挑战。
但这一首突破了原有亚洲音乐的主题、形式，综合了多元的音乐素材，歌曲风格多变，融合了中西式曲风的嘻哈。中西结合疗效好”似乎就是对这首作品的最好陈述，在唱词和加花方面运用东方本土的东西，而音乐进行的主干则引进西方的潮流文化，不得不说这样的做法在当时算的上是前卫的，先进的，时尚的。
一开口，周杰伦就唱出了“崇洋都被医治”的歌词；如若华佗仍在世，神医的医术即可救治。暂不说精神层面能否医治，只不过想突出的是中国历史上最具代表性的“神医”华佗。接下来引出的是整首歌要表达的思想——拒绝崇洋媚外！
围绕在歌曲标题周围的种种本土元素，都去除了实体意义，被抽象成文化符号。他在歌曲里用了很多中药的名字，无论是有毒的马钱子，还是便秘者买来泡茶喝的决明子...把这些药名串在一起，变成了一种饶舌歌，是一种音乐的创新。歌词里的中药名，在现在看来押韵X5（不得不佩服周董的实力）。那么歌曲中一共提及十六种中药名（不知道的可以去听几遍~数数看）。
周杰伦曾告诉记者，歌曲《本草纲目》的MV是自己导演的，不担心会因为有僵尸出现被禁播，在MV中本来是想用大僵尸的，但是觉得太恐怖，所以改用了可爱的小僵尸，他觉得是一种民族意识，僵尸是中国的，用这种方式来反击那些崇洋媚外的人，现在太多哈韩哈日的朋友，这首歌就是希望大家记住自己的祖先，多么辛苦，汉方的药是怎么形成的，在歌曲的最后作者给出了治疗“媚外内伤”的“千年汉方”：小僵尸蹲，暗巷点灯。为了配合这样的意境，《本草纲目》的MV里，一个贴着符咒的僵尸在屏幕的各个角落反复跳跃。
本草纲目只是个名号，比喻表面而已，比喻实体是治疗意识形态病态的医书，前后呼吁大家要珍惜传统文化，不要崇洋媚外，表达了对汉民族因被满清殖民那一份本该有的傲骨，那一腔绝不应该淡然的民族魂，还有那一份任谁也不能忘却的爱国情结，都在哼唱中被反复提醒。周董就是这样的潇洒自在，看似沉重的话题被一首流行音乐所取代，但深刻的意味并没有因为形式的自由而减少。
有人说，周杰伦是想借中医文化来“治疗”某些国人的崇洋媚外，也有人说这只不过李时珍的现代版告白，其实，不管哪种说法正确，歌曲的意义总是要靠心灵去领悟的，你听出来的是什么，那这首歌就是在讲什么，不必计较。
一部《本草纲目》记录的是中华传统医学的博大精深，而一首《本草纲目》唤醒的是国人对于自己民族宝藏的再一次瞻仰。